森林脑炎病原体属披膜病毒科，黄病毒属蜱传脑炎病毒。蜱传脑炎病毒远东亚型这是一种嗜神经性病毒，本病毒可以从患者脑组织中分离，用酚与乙醚处理后提取的RNA，有传染性。病毒接种恒河猴、绵羊、山羊、野鼠脑内可引起脑炎，该病毒能够在鸡胚中繁殖，卵黄囊接种或绒毛尿囊膜接种病毒能繁殖，也能在人胚肾细胞、鼠胚细胞、猪肾细胞、羊胚细胞、Hela细胞及BHK-21细胞中繁殖。
感染病毒后，在患者血清中可有血凝抑制抗体、补体结合抗体与中和抗体，其血凝抑制抗体起病后5～7天出现，2～4周达高峰，短期持续后下降；补体结合抗体在感染后10～14天出现，1～2个月达高峰，以后逐渐下降；中和抗体在急性期迅速上升，2个月达高峰，以后逐渐下降至一定水平，可持续多年。
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