1.急性膀胱炎 也表现为尿频、尿急、尿痛等膀胱刺激症状。但常有终末血尿，且尿中有大量白细胞，尿培养可发现有细菌。
2.腺性膀胱炎 也表现为尿频、尿急、尿痛等膀胱刺激症状。但B超检查可发现膀胱壁增厚或膀胱内占位性病变，膀胱镜可见乳头状物，而非浅表溃疡，活检可明确诊断。
3.膀胱结核也可表现为真性溃疡，常累及结核肾侧输尿管口周围，可有脓尿出现，尿检查可找到结核杆菌，泌尿系造影可显示肾结核的典型改变。
4.寄生虫病引起的膀胱溃疡类似于间质性膀胱炎的表现，一般男性多发，根据尿中找到虫卵或典型的膀胱病理特征可作出诊断。
5.非特异性膀胱炎则很少有膀胱溃疡出现，尿中常见脓细胞及感染菌，抗生素治疗很效。
6.Utz和Zinke(1974年)发现他诊断的男性间质性膀胱炎有20%是癌肿，故强调必须进行活组织细胞学的检查。
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