潜伏期为4～7天。妇女感染后表现为持续性阴道炎，起病可急可缓。临床表现为阴道分泌物增多，呈泡沫状，恶嗅味，黄绿色。排尿困难，外阴瘙痒。急性期持续1周或数月，病情轻重有波动，性交疼痛，月经期后症状加重。随后白带减少，症状减轻，亦可完全消失。阴道毛滴虫若在尿道或膀胱寄生，则可引起毛滴虫性尿道、膀胱炎。阴道毛滴虫能吞噬精子，可致不孕。阴道毛滴虫还能引起细胞发育异常及细胞核异常，癌症的发生率显着高于无滴虫妇女。检查发现，从阴道穹隆及子宫颈轻度充血到广泛糜烂、淤点及肛周糜烂及潮红的子宫内膜（草莓状子宫颈）。
