针灸科以传统针、灸、推拿与现代康复治疗手段相结合为特色。其针灸专科系国家级针灸重点专科、江西省南方灸疗中心、江西省医学领先专业、培训外籍医生的主要科室。该科经20年研究，将传统艾灸疗法创新为腧穴热敏灸新疗法，属医院原始创新的核心特色技术，获江西省科技进步一等奖。这是一种在灸态、灸位、灸法、灸量、灸感、灸效方面源于传统艾灸又不同于传统艾灸的艾灸新技术，能在70-80%的患者中高效激发感传，气至病所，临床疗效大幅度提高，已在全国27个省市推广应用。对内外妇儿诸种疑难杂病疗效独特。主要诊治中风偏瘫、外伤截瘫、面瘫、面肌痉挛、失眠、三叉神经痛、偏头痛、颈椎病、腰椎间盘突出症、骨性膝关节炎、肩周炎、风湿性关节炎、急慢性软组织损伤、肌筋膜炎、胃动力障碍、慢性腹泻、功能性便秘、支气管哮喘、过敏性鼻炎、耳鸣、耳聋、月经不调、痛经、慢性盆腔炎、男性性功能障碍等多种急、慢性病症。“小针刀”为引进的新技术，对颈肩腰腿痛有独特疗效。并开展了椎针及针灸“治未病”等新项目。该科同时通过综合运用现代康复治疗手段,包括:运动疗法、作业疗法、理疗、言语治疗、心理治疗、康复工程等，达到提高患者肢体运动功能、感知觉功能、言语功能、认知功能、吞咽功能、生活自理能力与职业能力的目的。