内蒙古自治区医院麻醉科成立于1982年，2002年被内蒙古卫生厅确定为内蒙古自治区麻醉专业的重点学科，它由临床手术麻醉、重症监护和疼痛治疗组成。目前已发展成为一个人才结构合理，整体素质较强的医疗、教学、科研为一体的二级学科一级临床专业科室。
　　
    麻醉科除了完成各类常规大手术麻醉外，同时开展各科的高难度的手术麻醉，如：肝、肾移植术，心血管手术如：非体外循环下冠状动脉搭桥术，各种肿瘤、妇产骨科、介入科等多项高难度手术的麻醉配合CT导向下主动脉金属支架放置术的麻醉，肿瘤侵犯气管隆突时的气管成形术及腹腔镜手术的麻醉配合。
　　
    ICU设立，解决了全院的重症病人的抢救治疗，ICU病房内设复苏床6张，配有心电监护仪，中心监护系统和美国进口PB7200全能呼吸机一台和德国产的西门子Servoi一台。不仅适用于全麻术后病人的复苏，也用于全院危重病人的抢救复苏治疗.
　　
    疼痛门诊治疗各种疼痛性疾病，对各种急慢性疼痛，如偏头痛、肩周炎、腰椎间盘突出症，全身关节痛、耳聋、失明、眩晕、带状疱疹后的神经痛等诊断和治疗中都发挥其技术专长，减少了疼痛，消除了病因。特别是术后镇痛的开展不仅可减轻病人的痛苦，减少了病人对手术的恐惧，还可预防和减轻由于疼痛对呼吸，循环和病人心理等多方面的不利影响。麻醉科在自治区率先普及深静脉穿刺术，直接参与全院危重病人抢救，通过深静脉能使病人得到高营养支持，通过静脉压测定可确保病人的正确输入量，使病人得到及时治疗，特别是对“晚期肿瘤癌疼痛的研究”现已推广到家庭病床进行治疗，达到满意效果，荣获自治区科技进步三等奖。