为了适应高新武器装备试验、现代军事斗争准备、载人航天以及公共突发事件医学保障的需要，2002年成立特种伤病科。该科是解放军总装备部特种伤病的医疗和研究机构。在神舟四号、五号、六号的医疗保障中做出突出贡献，荣立集体三等功，2004年成为总装备部特种医学中心。
任务：以载人航天航天员的医疗救护及保障、特种武器损伤、特殊环境损伤、特殊军事作业损伤及各种突发事故为重点，对特种伤病进行诊治、研究和预防。日常临床主要从事烧伤整形及中毒救治工作。
二、专业特色：
       该中心拥有国内一流的野外救治装备、设备，主要用于载人航天医疗救护。高档实验仪器主要有流式细胞仪等可对外使用。集院外救援、院内手术和特种伤病研究为一体。对特殊病因、特殊环境的意外伤害的全程救治有较高水平。目前正在筹备成立“突发事件医学保障”专业委员会。
在“载人航天航天员意外伤害的防治”、“火箭推进剂致伤的基础研究与临床救治”、“爆炸复合伤的紧急救治”、“反化学恐怖医学应急救援”、“降低MODS病死率”等方面达到国内外先进水平。中心配备全套高级便携式快速诊断、监测、治疗设备和特种医学实验设备。目前在研的有中国工程院、北京市科委、全军“十一五”项目等重大课题。