耳鼻喉科创建于1945年，当时主任是王鹏万教授。1952年院系调整，耳鼻喉科从中山医院、华山医院撤出，成立现在的眼耳鼻喉科医院。1976年中山医院恢复耳鼻喉科。著名耳鼻喉科专家黄鹤年教授、常荣先教授、万廷钰和范显谟等先后在科室工作和担任主任，现任科主任为王建中和黄新生副主任。

    集医疗、教学、科研为一体，拥有耳显微镜、鼻内窥镜、电视喉镜，纤维鼻咽喉镜、微波治疗仪和鼾症的射频消融仪等先进的诊断和治疗仪器。
   全年门、急诊约3万人次，主要治疗耳鼻喉科常见病及各类疑难杂症，并能开展耳鼻喉科的各类手术，尤以耳鼻咽喉--头颈部肿瘤的外科治疗、鼻内窥镜和喉内窥镜手术、鼾症的手术和射频消融治疗为特色。

    依托医院的综合实力，与胸外科、脑外科、口腔科和介入科等合作开展
    ·空肠移植重建喉咽治疗晚期喉咽癌手术，并获培林医学一等奖。（在上海市率先开展）
    ·术前选择性血管栓塞治疗鼻咽纤维血管瘤手术。（在上海市率先开展）
    ·耳部肿瘤的颅外根治术。
    ·Le Fort I 经上颌入路颅底肿瘤切除术。
    ·鼻内窥镜和喉窥镜下的功能性、微创手术。
    ·与呼吸科合作成立睡眠呼吸障碍诊治中心。