内蒙古医学院第二附属医院神经外科成立于1994年7月。现有病床34张，医护人员14名。其中主任医师一名，副主任医师一名，主治医师二名，硕士研究生二名，并且具有一支较高专业护理水平的护理队伍。
     
    我科主要以研究与诊治神经外科各类疾病，诊治范围包括各种类型的颅脑损伤、脑与脊髓肿瘤、脑与脊髓血管病，脑与脊髓的各类炎症、脓肿，以及痉挛性疾病。科室成立十年来，在神经系统疾病的诊治方面作了大量的工作，为自治区神经外科的发展做出了巨大的贡献。同时担负自治区级科研和临床教学工作，神经外科具备招收硕士研究生资格。成功完成内蒙古自治区科委攻关项目2项，发表科研论文50余篇。
     
    我科是自治区唯一可以开展计算机立体定向手术技术的专业科室，可用于诊治多种颅内疾病，达到国内较先进水平，为自治区填补了多项空白，代表自治区立体定向神经外科的最高水平，获自治区科技进步三等奖。
     
    由于我院的骨科专业特色，我科在全区率先引入脊柱脊髓神经外科的概念，并且在这一领域开展了许多工作。尤其是脊髓肿瘤疾病的诊治更在自治区具有领先水平，脊髓肿瘤的手术治疗无论是病例数还是肿瘤种类均占各家医院之首，特别是脊髓内肿瘤的显微手术治疗、脊髓栓系综合征、各类脊柱脊髓的先天性畸形的综合手术治疗均达国内较先进水平。
     
    我科从1996年开始在自治区首先开展将皮层电极术中监测技术用于难治性癫痫的综合手术治疗，取得令人满意的疗效，填补了自治区功能性神经外科的空白，为我区逐步广泛开展癫痫外科和功能性神经外科起到了良好的推动作用。

    综合外科成立于2005年7月，是在我院奉行“大专科，小综合”的宗旨下成立的新的专业科室，满足各类病人求医的需要，主要收治胸外科、普通外科的各类病人。科室成立以来，很好的解决了各个科室对于复合外伤病人进行协同诊疗的问题。