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建院时设中、西药房，并设药库和煎药室，1981年正式成立药剂科。现有正式职工43人，主任药师1人，副主任药师3人，主管药师25 人，药师6人，药士3人， 22人取得了全国执业药师资格证书。下设门诊中、西药房；病房药房；中西药库；临床药学室等部门，医院设立药事管理委员会，主要负责组织实施包括中、西药的调剂，药品采购供应及药品质量控制、临床合理用药、临床不良反应监测等药事管理工作。
药剂科承担着全院34个病区、1100张病床、年均近50万门诊人次的药品的供应工作。现有各类中西药品 1300多种，中药饮片300种，药房与各个病区电脑联网，药品配送实现信息化。
成立了临床药学室，由1位主任药师、2位主管药师负责，开展药物临床观察和不良反应的监测，对临床医生的处方进行分析监督，为患者和医生提供合理用药咨询服务。
承担着六所医学院校药学专业部分学生的带教实习任务。近年来，获市级科学技术进步奖7项，其中二等奖1项，三等奖6项，在国家级刊物发表论文7篇，在省级以上刊物发表论文48篇，主编著作2部，参编著作5部。
