中国人民解放军总医院微生物科前身是解放军总医院检验科细菌室。1953年建院初期仅为2人组成的细菌室，1987年初成为独立科室。首任科主任为周贵民教授，现任科主任沈定霞教授于1999年接任。

    科室构成包括细菌室、血清室、分子生物室以及研究室。现有高中初各级技术人员12人，其中高级职称3人,中级职称5人，初级职称人员3人。

    工作质量方面建立了一套较为完整的质量管理体系。并定期参加卫生部临床检验中心、北京市临床检验中心以及世界卫生组织等机构组织的室间质评活动。目前正在进一步完善实验室质量管理、生物安全管理、操作规程的修订工作，按照ISO9000标准以及美国临床微生物学操作规程要求，不断改进，使科室各项管理迈向更高水平。

    微生物科作为硕士学位授权点，已培养硕士研究生8名，并有上百名军内外微生物检验人员在我科研修或实习。

    微生物科将始终坚持姓军为兵的服务方向，努力做到使临床和病人双满意，注重检验质量，在保证完成医疗工作的同时，积极开展科学研究，保持我科在国内临床微生物检验领域的先进水平，并积极跟踪国外发展，使之成为既能检测各种病原微生物，又有研究特色的一流临床微生物学实验室。

    承担的主要任务有：1、临床微生物病原学及免疫学诊断；2、保健任务，参加与首长保健有关的检查与临床会诊； 3、医院感染细菌耐药性监测及耐药机制研究；4、教学，包括研究生、进修生、实习生以及院外部分单位的临床微生物学教学工作；5、科研，自微生物科成立以来，开展过 艰难梭菌分离及其毒素检测、临床分离酵母菌鉴定及耐药性检测，对院内感染病原菌的耐药性检测及监测、耐药机制以及分子流行病学研究是我室目前的主要研究方向。