哈尔滨市中医院肛肠科前身是哈尔滨市肛肠医院，该院是一所有着20余年历史，治疗肛肠病的专科医院。经过医务人员的共同努力，已经形成了独具特色的医疗技术和治疗方式。2001年哈尔滨市肛肠医院与哈尔滨市中医医院合并后，医院确立用“大专科带动小综合”的发展方向，同年6月肛肠科被黑龙江省中医管理局批准为“哈尔滨中西医结合大肠肛门病治疗中心” 。2003年8月被黑龙江省中医管理局批准为“黑龙江省中医肛肠病重点学科”、“黑龙江省肛肠病继续教育基地”，该科室“肛肠物理检测实验室”被认定为国家二级实验室，从而确立了省内本专业的“龙头”地位。2004年底肛肠科通过“黑龙江省中医重点专科”验收，2006年底被确定为哈尔滨市肛肠外科重点学科，2007年2月被确定为黑龙江省重点学科。

    专科现有医务人员37人，其中：主任医师7人、副主任医师16人、主治医师8人、住院医师6人；有6人获得硕士学位。现有中华中医药学会理事1人、全国中医肛肠分会副主任委员1人、委员1人；全国中西医结合肛肠学会委员2人；省中医肛肠专业委员会主任委员1人、副主任委员1人、委员2人；省中西医结合肛肠专业委员会委员5人、省医学会肛肠专业委员会委员1人，黑龙江中医药大学兼职教授硕士生导师1人。
肛肠科现有床位230张，设有结直肠外科病区1个，肛肠病区6个，每年完成门诊6000余人次，手术2700余例，收入1500余万元。

    现开展肛肠科各种常见病、多发病治疗，还开展肛肠科疑难病及危重症的治疗，如直肠阴道瘘、直肠脱垂、大肠癌低位和超低位直肠癌保肛根治术、肛肠畸形的矫形、肛门失禁、肛肠外伤、无痛性肛门疾病手术治疗、直肠前突经阴道或直肠修补术、肛门括约肌修补术、先天肛门闭锁、结肠癌的手术治疗、结肠次全切除术治疗慢传输性便秘、PPH手术等。

    中心具有代表性的是：肛肠手术后镇痛技术彻底解决了肛肠病术后疼痛的问题；开展微创手术超声刀、血管闭合器、氩气手术刀的应用，“双侧臀大肌带骨膜顶襻移植肛门括约肌成形术”在肛门失禁及先天性肛门发育缺陷的治疗，本方法目前尚属国内首创，达到国内领先水平；在出口梗阻研究和治疗方面处于省内领先地位，曾多次获奖。在省内率先开展结肠慢传输试验、气钡灌肠双重造影、X线排粪造影、超声波直肠腔内检查、肛管直肠压力测定、电脑直肠影像检查等多项肛肠专科检查。

    采用中药口服、中西药灌肠、腔内治疗相结合，治疗溃疡性结肠炎、克隆氏病等炎症性肠病，取得了较好的疗效。采用生肌玉红膏、 四黄膏、九华膏等中药，治疗肛周脓肿、炎性外痔、血栓痔、伤口愈合缓慢等病症；达到加速伤口愈合、消炎、止痛、生肌的临床效果。配制有痔瘘外洗1号液、痔瘘外洗2号液，用于各种肛门直肠病及肛肠术后熏洗；采用中西药合剂治疗便秘；采用中药加放化疗，治疗结-直肠癌术后和癌症晚期患者。

    专科现有6个标准化手术间，科室装备有专科检查治疗设备，如日本奥林帕斯电子胃镜及电子肠镜、美国产氩气手术刀、德国产超声刀、台湾产高频手术电刀、多通道下消化道动力检测仪、丹麦产肌电图诊断仪、带直肠探头B超、X线排粪造影、电脑洗肠机等。

    中心现有专科研究室，有开展本专科临床科研所必需的设备。中心“肛肠物理检测实验室”被认定为国家二级实验室

    肛肠中心近年来有十几项科研成果在省市获奖；目前的科研项目有4项：国家中医药管理局1项、省卫生厅1项、市科委1项、市卫生局1项。近年来出版了5部著作，发表国家、省市级论文60余篇。

    为基层医院及专科医院培养了大批肛肠专业人员，4年来共培养广东、辽宁、吉林、内蒙古、黑龙江等各省市进修医生116人。

    总之，我院大肠肛门病治疗中心是省内治疗肛门直肠疾病诊治的龙头单位，其医疗任务、诊疗水平、科室规模、综合实力在全省居于领先地位，在国内有较高的知名度，在群众中有较高的信誉。