上海市肺科医院呼吸科是我院重点科室之一。 诊治范围涵盖了除结核病和肺部肿瘤之外的所有呼吸系统疾病。目前开放病床109张，其中重症监护病房4张。2002年成为苏州大学医学院硕士学位授权点。2005年成为同济大学医学院硕士学位授权点。现有医、教、研、护各级人员共46名，其中教授、主任医师2名，副主任医师3名，主治医师6名。所有的医师均具有本科学历，其中博士研究生1名、硕士研究生8名。年平均门诊量8000余人/次，住院病人约1200余人/次。

　　科室医疗特色：
　　以疑难肺部疾病的临床诊治为最显著的医疗特色。包括间质性肺疾病、结节病、难治性哮喘、慢性阻塞性肺疾病、下呼吸道难治性感染、肺栓塞等国内外公认的疑难肺部疾病。例如，间质性肺部疾病收治量仅2003和2004两年就超过以往10年的总和，间质性肺疾病的病人数占到同期所有住院病人的40%左右。正确诊断率达到95%以上，治疗有效率达到90%以上。由于在这方面积累了较为丰富的经验，因而吸引了上海地区乃至全国各地的疑难病人，形成了事实上的上海市乃至华东地区间质性肺病临床诊疗中心。又如，肺栓塞诊治方面在上海市收治病例数最多，形成一套完整的诊治方案，培养了一批临床、影像和超声诊断人才。

　　科研、教学情况：
　　近5年承担上海市科委和上海市卫生局课题9项，获得经费200余万元。发表论文100余篇，其中2篇被国际权威检索刊物SCI收录。参编专著5部。2004年成功举办了国家级继续教育学习班“疑难肺部疾病继续教育学习班”。独立招收和培养苏州大学在读硕士研究生6人。2005年开始独立招收同济大学硕士研究生3名。每年培养来自全国各地的进修医师30余名。目前是中华医学会全国间质病学组的副组长单位、华东地区间质病协作组组长单位、上海市间质病学组组长单位。