诱发窦性心律不齐的原因有多种，有病理性的，也有非病理性的。
第一种诱发窦性心率不齐的原因，也就是呼吸性窦性心律不齐，发生机理是由于在呼吸过程中，体内迷走神经与交感神经的张力发生变化，使窦房结自律性也因之发生周期性、规律性改变。吸气时交感神经张力增高，心率增快，呼气时迷走神经张力增高，心率变慢。心率快慢变化的周期恰等于一个呼吸周期，停止呼吸时心律转为规整。这种心率失常一般多发于儿童、青年和老人，属于一种正常的生理现象。
第二种诱发窦性心率不齐的原因，也就是引起非呼吸性心率不齐的原因，尚不十分清楚，有人认为与生气、情绪不稳定、或使用某些药物(如洋地黄，吗啡等)有关。
第三种诱发窦性心率不齐的原因为与心室收缩排血有关的窦性心律不齐，是由于心室收缩排血异常致窦房结血液供应不均匀，从而造成窦房结的自律性发生改变而诱发的。
第四种为异位心律诱发的窦性心率不齐。因异位激动，尤其是发自心房的异位激动，有时可使窦房结的激动提早发生，继之窦房结受抑制，因而发生一过性异位激动所诱发的窦性心律不齐。
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