(一)发病原因
鼻窦黏液囊肿的确切病因仍有争论，一般认为可能为先天性自然窦口狭小或多种原因所致的窦口阻塞，最常见的为鼻窦慢性炎症、变态反应性水肿及息肉等。肿瘤，特别是筛、额窦基底细胞癌、转移性肿瘤，累及鼻额管的骨折、先前的鼻窦手术等亦可产生窦口的阻塞而继发鼻窦的囊性扩张，黏液潴留并进行性加压使囊肿充满于鼻窦，继而侵蚀和穿过眶壁并使眶内软组织移位，此称为继发性黏液囊肿。另一种理论认为小囊肿发生在鼻窦的衬里，也许来源于肿胀的高脚杯细胞(goblet-cell)。当囊肿增大，最终使鼻窦关闭，囊肿压迫和侵蚀相邻骨质，此称为原发性黏液囊肿。
(二)发病机制
20世纪70年代以来，认为黏液囊肿是由于鼻窦分泌物蛋白质含量过高所产生的一系列生化和免疫反应所致，即窦内渗透压增高，吸收水分充满于窦腔而致窦内压力增高。骨壁内的破骨细胞被前列腺素、甲状腺素、维生素D等激活，同时淋巴细胞产生的破骨细胞激活因子亦参与，使窦壁被破坏。
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