(一)治疗
大环内酯类抗生素为首选。用红霉素40mg/(kg·d)或罗红霉素、阿奇霉素每次10mg/kg,1次/d口服，连服3天，停药4天，为1个疗程。克拉霉素等，连续口服约2～3周，可使病程缩短。不能口服或重症者静脉滴注红霉素，每次15mg/kg，2次/d;或用罗红霉素每次4mg/kg，克拉霉素每次10mg/kg，2次/d口服;青霉素族及氨基糖甙类均无疗效。本病预后良好，但有报道患儿痊愈随访7～8年后，一部分儿童仍有呼吸道症状如咳、喘和肺功能异常。
(二)预后
本病病程迁延，长达数周，但多可治愈，鹦鹉热衣原体肺炎重症病死率高，但近年来应用有效抗生素治疗后，病死率明显下降。有作者经血清学调查发现肺炎衣原体感染与冠状动脉粥样硬化性心脏病之间有关联，亦有人发现肺炎衣原体感染可引起哮喘或哮喘性支气管炎，值得研究。
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