消毒杀虫科负责深圳市医疗机构、消毒产品生产企业、感染控制重点行业的消毒效果监测、评价和技术指导，从事消毒剂、消毒器械的消毒效果鉴定及医疗卫生用品质量鉴定，是全市消毒检验、培训、指导、科研与服务中心；负责深圳市病媒生物监测和防制技术的研究，并对杀虫灭鼠药械进行质量鉴定和效果检测，是全市病媒生物监测与控制技术指导中心。

消毒杀虫科的消毒实验室按照卫生部消毒鉴定实验室要求建立，拥有10000级无菌室、1000级无菌室、100级超净工作台、酶标仪、分析天平、恒温培养箱、低温培养箱、低温冰箱、紫外分光光度计、显微镜等检测设备，除能开展常规消毒监测工作外，还能进行科学调查与研究。病媒防制组建有蚊、蝇、蟑螂饲养室、生物测试室、模拟现场测试室、昆虫标本展示室等，能开展多种杀虫灭鼠药械的性能测试。

消毒杀虫科通过开展全市各级医疗机构与托幼机构的消毒监测与消毒技术指导工作，及时掌握深圳市医疗机构与托幼机构消毒工作动态，提出合理意见和建议，为决策部门提供技术支持，有效预防和控制院内感染和传染性疾病的发生；通过对病媒生物的监测与控制工作，及时掌握深圳市主要病媒生物的种群分布、生态习性和季节消长情况，研究防制措施，做好预测预报，并对杀虫灭鼠剂的抗药性进行定期监测研究，为全市范围内开展除四害工作提供技术支持，特别是为全市爱国卫生运动委员会制定相应的对策提供决策依据，为政府部门实施重大疾病预防控制措施中涉及的消毒、病媒防治工作提供有关科学依据和技术保障；此外，消毒杀虫科多年来一直承担深圳市重大接待活动的预防性消毒，传染病疫源地、公共卫生突发事件的现场消毒及技术指导；组织配合全市消毒、杀虫、灭鼠相关知识的宣教工作。

消毒杀虫科承担一次性医疗用品、卫生用品、消毒剂、消毒器械、杀虫灭鼠药械的产品检测和卫生学评价工作；开展对外消毒、杀虫服务，并对消毒及有害生物防制服务机构进行培训、技术指导和效果监测。