肿瘤内科是内蒙古首家治疗恶性肿瘤的专业科室，目前已发展成为自治区最具专业优势的肿瘤预防、诊断和治疗中心，形成集手术、放疗、化疗和治疗于一体的综合性治疗体系。1982年内蒙古自治区肿瘤防治研究所在我院成立，担当起自治区肿瘤的科、教、研工作。在肿瘤的诊治方面，已达国内先进水平，处于自治区领先水平，使大部分肿瘤患者得以治愈，为数以万计的肿瘤患者带来了福音。
目前拥有的大型医疗设备有：医科达进口直线加速器放疗机、X线放疗刀、进口CT模拟定位机等，以上设备达国内先进水平。同时拥有C060放疗机X线放疗机、支气管镜、呼吸机、心电监护仪、心脏除颤器等。
肿瘤科积极开展新技术，其中”乳腺癌X线———病理定位取材对癌研究“获自治区科技进步一等奖及卫生部甲级成果奖；“全区肿瘤死亡回顾调查”获卫生部科学大会奖；“翻转胸肌瓣式乳癌根治术的研究”获自治区科技进步三等奖。
