儿科创建于1984年，目前开放床位100张，开设儿一病区、儿二病区和新生儿重症监护室。医护人员30余名，其中高中级职称10余名，硕士研究生3名。对小儿常见病、疑难病、传染病和新生儿疾病的诊治有丰富的临床经验，并以先进完善的医疗设备作后盾，对儿童哮喘、新生儿呼吸窘迫综合征、极低出生体重儿、重症贫血、营养性疾病、重症肺炎合并心衰、呼吸衰竭等危重病人有较高水平的综合抢救能力，在社会上有良好的声誉。儿科开展的婴儿高压氧治疗走在了全省前列，并在全区开展了首例新生儿PICC技术。就诊的人员除余杭区外，辐射至下沙、部分杭州地区、海宁、桐乡、德清等周边地区。2005年4月成功抢救全国首例试管婴儿三胞胎姐妹，引起社会各界的广泛关注。儿科全体医务人员以高度的责任心、良好的服务态度、精湛的医术赢得更多患儿和家长的肯定。在余杭区卫生系统首届“创三名”活动中，昌晓军主任医师被评为名医。
