南京大学医学院附属口腔医院口腔内科是江苏省省级临床重点专科，南京市重点专科。该科室医疗技术先进，人才济济，目前有高级职称专家近20人，其中近10名担任国家、省、市级专业委员会委员，现有硕士20余名，博士3名。科室近年来获省、市科技进步奖数十项，目前正承担省级一项、市级课题十三项。近五年来发表论文、综述、译文百余篇，出版著作10余部。该科被国务院学位委员会授予口腔临床医学硕士点，招收3年制口腔医学硕士研究生及7年制口腔医学硕士，有硕士生导师4名，已培养硕士研究生30余名。现为江苏省卫生厅口腔内科进修基地，多次成功举办国家级、江苏省和南京市继续教育项目学习班。
   
    该科室除常规开展牙体牙髓病、尖周病、粘膜病、牙周病、儿童牙病等的治疗工作外，一些特色技术项目已达到国内及国际先进水平。2000年率先采用先进的NiTi器械行冠-根向预备和音波根管治疗，2001年率先引进纳米树脂，2004年率先引进使用陶瓷光固化树脂，2004年省内率先开展显微根管治疗术。对于断钉(针)取出、髓腔侧穿和髓底穿孔修复均达到国内领先水平。粘膜病科室应用中西医结合的方法治疗口腔常见粘膜病，大大提高了临床疗效；口腔粘膜癌前病变的诊治、全身疾病在口腔表证的早期诊治等达到国内先进水平，担负全省及部分外省市的口腔粘膜病尤其是疑难病的诊断、防治任务。各类牙周病的手术治疗；牙周植骨术；牙冠延长术；引导牙周组织再生的研究等，在省内处领先地位，有些项目达国内先进水平。儿童齿科开展的根尖诱导成形术、窝沟封闭术、乳牙根管治疗等一系列诊疗技术研究项目达到省内先进水平。保存齿科开展的断牙再接术和复合树脂加银汞联合修复方法等技术达省内领先地位。
   
    该科室设备精良，配有国际先进的牙科综合治疗台和国际名牌牙钻机头，均做到一人一用一清洗一消毒，在防止交叉感染方面名列全国同行业前列。该科室年收治海内外患者近20万人次，已成为国内最有影响的口腔内科专业科室之一。