神经外科
神经外科作为上海蓝十字脑科医院特色科室之一。我国神经外科的先驱唐镇生、侯增欣等国家特殊津贴级专家在我院开展了高难度疑难脑瘤手术。其后，我国著名的神经外科专家潘仁龙教授、王守臣教授、王庆明博士等为我院神经外科的发展和壮大做出了巨大的贡献。
上海蓝十字脑科医院神经外科目前已累计完成脑瘤手术近万例，治疗效果达到国际先进、国内领先的水平。立足脑瘤诊治这一传统特色的同时，努力在其他专业取得突破：尤其是脑胶质瘤综合治疗、脑积水、脑外伤、颅骨缺损等专业领域发展势头迅猛，达到了国内的先进乃至领先水平。
我科现开展多项神经系统疾病的手术治疗：包括大脑、小脑、脑干、颅底和椎管内的原发和继发性肿瘤；脑外伤治疗、脑积水微创手术等。脑胶质 瘤综合治疗、脑积水、脑外伤、颅骨缺损等专业领域发展势头迅猛，达到了国内的先进乃至领先水平。我科现开展多项神经系统疾病的手术治疗：包括大脑、小脑、 脑干、颅底和椎管内的原发和继发性肿瘤；脑外伤治疗、脑积水微创手术等。

功能神经外科
我院成立功能神经外科，是全国首家功能神经外科领域的临床治疗和科研机构，其体制规划凝聚了专家的智慧与心血。 张涵博士、徐侃教授作为功能神经外科的领衔人，集多年神经科学领域的所学和丰富的疾病治疗经验，开设：癫痫、小儿脑瘫、帕金森病、三叉神经痛、面肌痉挛等疾病项目，治疗成功率达到98％以上，成为亚洲唯一获此殊荣的临床机构。癫痫中心借鉴国际同行多年的理念和经验，对顽固性癫痫的治疗与世界水平齐步走。采用微创技术，对慢性顽固性疼痛的治疗提供了一种终极选择的手段，使三叉神经痛等患者重返健康生活。针对日益增多的脑瘫患者，采用微创的、高选择性的和多水平的治疗，极大地缓解了他们的行走困难，增强了肢体灵活性。还成功地对一些严重的精神病患者实施了外科手术，使他们重返工作和学习岗位。

神经内科
我院开设的神经内科为医院重点学科，拥有全国著名专科教授十名，由中华医学会神经科学会会员，博士生导师刘道宽教授、经验丰富的李振并主任医师、脑血管病权威专家陈厚信主任、神经内科程国汉教授等领衔，拥有中华医学会神经内科分会全国委员、全国神经病理学组委员、上海医学会神经病学分会常务委员等，国内著名专家。
  神经内科现开展脑血管疾病的一级预防二级预，防脑梗死的早期溶栓治疗。有效治疗脑血管病，头痛头晕、失眠、抑郁、焦虑症等疾病，可以为神经内科的疑难病罕见病提供准确和全面的诊断和治疗手段。