手术室分五间手术室、麻醉室以及苏醒室等等附属房间组成其中净化级别为百级的一间，主要用于心脏手术和骨科关节置换等大型手术，千级的一间，主要用于脑外科、眼科和骨科的一般手术，万级的三间，主要用于普外、泌尿、妇产、五官等的手术。手术室配备完善，引进了一批先进的仪器，如骨科的Everview 7500 L型臂、脑外科的Lorder显微镜，眼科专用的从加加拿大进口的STAT1m 2000卡闭式灭菌器和0M-10眼科手术显微镜，还有先进的治疗白内障的超乳器械，除此之外每个手术间内还配有德国进口的Eagle 3000监护仪，Datex-ohmedn麻醉机，以及Sube 2400 电刀和Done lux 无影手术灯。另外，根据医院微创手术的需要，各种微创腔镜也广泛应用（腹腔镜、电切镜、膀胱镜、鼻内镜等）。
作为现代化的手术室也是数字化的手术室，采用智能化设备进行管理，通过设在微电脑集中控制板可进行电源监控、空调监控、时间控制、灯光控制、开关控制、空气净化系统控制、对讲、背景音乐控制、无影灯控制、手术过程中还可以通过全程摄像系统监控手术室内发生的一切，对于一切突发事件有很好的应急处理措施，同时也丰富了临床医学教育手段。