消化科为市级重点专科，江苏省十一五中医重点临床专科建设单位，拥有专科门诊、专科病房、消化内镜室和孟河医派脾胃病研究室，已开放床位20张，年住院病人500余例，年门诊量35000余人次。本科现有主任中医师4名，副主任中医师1名，副主任医师3名，主治中医师1名，住院医师和住院中医师各1人，其中全国名中医1名，市级名中医1名，南京中医药大学硕士生导师2名，博士后1名，硕士2名。目前主持的在研科研课题3项，即：国家自然基金项目：“思伤脾” 中医证候特征及病变机制研究，江苏省中医药管理局课题：扶正祛邪法治疗肝硬化血清内毒素血症的临床研究，常州市卫生局课题：清热化湿法治疗幽门螺杆菌感染。
       
    消化内镜室拥有奥林巴斯电子胃镜、电子结肠镜和十二指肠镜及其配件，已开展常规胃镜，结肠镜检查，消化道出血的内镜下止血，消化道息肉的微波治疗、电凝电切除术等和消化道良性或恶性狭窄的扩张及置入支架治疗等，ERCP，鼻胆管引流及胆道取石等项目。胃幽门螺杆菌呼气检测及快速尿素酶试验等。
       
    诊疗范围：消化系统疾病，包括：食管炎，食管溃疡，胃食管反流病，慢性胃炎（包括浅表性，萎缩性，糜烂性），功能性消化不良，胃溃疡，十二指肠球部溃疡，上消化道出血，食管胃底静脉曲张出血，肠易激综合症，溃疡性结肠炎，克罗恩病，急性胰腺炎，脂肪肝，酒精性肝病、慢性肝炎，肝硬化，胆囊炎，胆石症及消化系统肿瘤等的中西医结合诊疗。
       
    特色专科制剂：胃Ⅲ合剂、黄白止血散、胃舒胶囊、溃疡灵等。
       
    特色治疗：溃疡性结肠炎的中药灌肠治疗，萎缩性胃炎的中医治疗，运用中医脾胃理论治疗脂肪肝、慢性肝炎和肝硬化腹水。
       
    学科重点研究方向：扶正祛邪法治疗肝硬化血清内毒素血症；清热化湿法治疗幽门螺杆菌感染；孟河医派脾胃学术研究；疏肝健脾法治疗肠易激综合症；情志因素与中医脾胃病相关性研究；健脾化痰法治疗脂肪肝和慢性胃肠疾病。