常熟市临床脑科医学中心定点于二院，分设神经外科、神经内科。
    神经外科是苏州市、常熟市临床重点专科，为常熟市规模最大、技术实力最强的神经外科诊疗中心，在广大人民群众中享有盛誉。
    神经外一科目前有正副主任医师7名，主治医师6名，其中硕士研究生6名，设床位74张。拥有通用16排螺旋CT、通用1.5TMRI、西门子DSA、LEICA手术显微镜、黑金钢高速气动磨钻、安科立体定向头架等先进设备。开设颅脑创伤、颅脑肿瘤、神经介入、功能神经外科等专业方向，多年的临床工作卓有成效，积累了丰富的救治经验，建成了一支技术高超、积极进取的专科队伍。科室获得市级科技奖5项，在专业核心期刊发表60余篇学术论文，承担多项市级科研项目。
    神经外一科以重型颅脑外伤救治为特色，自成立以来已成功抢救颅脑外伤病例达25000余例，抢救成功率达到国内领先水平。重型颅脑外伤通过颅内压监护、脑温监护、亚低温治疗、呼吸机辅助呼吸、及时手术减压、后期高压氧康复锻炼等联合救治措施取得了可喜的成果，治疗效果在苏州市遥遥领先。近年非常重视患者的功能康复，大幅度提高了颅脑外伤病人生活自理和重返社会的适应能力，和国际最新发展同步。颅内肿瘤也已积累了上千例成功手术病例。从常见的各部位胶质瘤、巨大的脑膜瘤到垂体微腺瘤、听神经瘤，还有相对少见的血管母细胞瘤、海绵状血管瘤、高位髓内肿瘤等等都有手术完美全切的记录，尤其是部分病例通过先进的显微锁孔技术完成，更为微创。整体手术效果在全省领先。神经介入经过多年发展目前已经进入高速发展期，为常熟市重点发展亚专科。除常规进行全脑血管造影、脊髓血管造影等介入检查外，已开展脑动脉瘤、脑血管畸形、颈内动脉海绵窦瘘、硬脑膜动静脉瘘、颈动脉狭窄等多项介入治疗，多项目填补了常熟市空白，为我市人民带来了先进科技的服务。目前已经成功开展了350余例。在常熟市首先应用立体定向技术治疗帕金森氏病、顽固性癫痫，业已成功完成140多例。功能神经外科正进一步向更高难度的领域进军。
    神经外二科以颅脑创伤、颅内肿瘤、脑血管病及功能性神经系统疾病等的规范化诊疗为主，特重型颅脑外伤系统治疗、颅脑肿瘤显微手术为病区传统强项，急诊手术均由绿色通道第一时间完成。出血性脑血管病如脑动脉瘤、脑动静脉畸形、颈内动脉海绵窦瘘等神经介入和微创手术治疗为病区特色，已获苏州及常熟市新技术引进奖5项。高血压脑出血显微手术为病区诊疗优势项目，手术疗效满意，是市卫生局新技术引进项目，能为患者提供最及时、准确、有效的个性化医疗服务。病区开展的三叉神经瘤，面肌痉挛等的微血管减压手术创伤小，疗效高。