南京市第一医院泌尿外科是南京市临床重点专科，国家级药物临床试验基地，南京医科大学、东南大学医学院硕士培养点，现有高级专业技术职称人员7名，教授、副教授5名，硕士生导师4名，硕、博士8名，床位65张。该科的专科特色有：1、泌尿系统肿瘤的特色治疗 ；2、微创泌尿外科：此项目是南京市及省内率先开展的泌尿外科微创手术。3、尿流动力学检查；4、泌尿系结石的诊治；5、男科学。该科设备齐全，有钬激光治疗设备；气压弹道碎石设备；膀胱镜；电切镜；尿道冷刀；经皮肾镜；输尿管镜（软镜、硬镜）；电视腹腔镜；体外冲击波碎石机；尿流动力学检测仪等。
