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中医科初建于1956年，只开展病房会诊和门诊工作。1962年，开设中西医结合病床17张。医院恢复后至1973年中医科恢复，开设中西医结合病房27张。1990年中医科迁至干部病房楼，开设病床28张。1995年以后介入科迁入中医科病区，中医科病床由原来的28张缩减为13张。
中医科科研工作的内容主要有：传染性肝炎、肺脓疡、腹水、肾病等15种疾病的研究工作。独家研制的“妇乐舒”新药开发工作已报安徽省卫生厅和国家卫生部审批;出版了《新急腹症学》专著。
