成立于1964年8月，1986年7月编制为传染病学教研室，1988年改为感染科至今。1986年、2002年先后批准为硕士、博士学位授权学科。建科初期床位10张，现开设50张。现有各类人员28名，其中高级职务人员3名。
该科自传染病科改建为感染科后，无论是科室规模还是人员结构均出现很大变化，由一个弱小的科室逐渐发展成为一个拥有50张病床(现病房位于闸北区中心医院内)，年收治患者800余人次、门诊2万余人次、在国内军内享有一定知名度的临床学科。改建后科室扩大了业务范围，也提高了诊疗水平。经几代人努力，形成了以病毒性肝炎的诊治、免疫功能低下感染的诊治、长期原因不明发热性疾病的诊治、肝脏移植后的内科处理、肝炎病毒分子生物学检测等学科特色。感染科还是国家临床药物验证机构肝病专业组。
