1979年成立肾内分泌组。1980年正式组建肾内分泌科，4个人，10张床。1990年肾内分泌科分建为肾内科和内分泌科。肾内科于2000年被批准为全军肾病医学中心，2005年批准为全军肾脏病研究所。1990年、1996年先后批准为硕士、博士学位授权学科。现有床位63张，血液净化仪66台。现有各类人员77名，其中高级职务3名。
历任主任：张本立、梅长林。副主任：叶朝阳、赵学智。
该科以救治各种肾炎、尿毒症、多囊肾病为特色。年收治急慢性肾炎、多囊肾病、肾小球疾病、肾间质疾病及继发性肾脏疾病患者1000余例。在国内较早开展肾脏穿刺活检、动静脉内瘘术、腹透管置入术、血液透析等技术。1981年1月13日，肾内科开展首例肾活检术获得成功，是国内较早开展肾脏活检的单位之一，至今已积累活检病例近600例。该科建有上海市最大的血液透析中心，现有血液净化仪66台，其中血透机58台、血透血滤机5台、床旁连续性肾脏替代治疗仪3台。肾内科也是国内较早开展腹膜透析的单位之一。
肾内科拥有较大规模的研究室，配有一系列较先进的分子生物学、细胞生物学和病理学研究仪器。获上海市医学科技奖一等奖1项，中华医学科技奖二等奖1项，军队医疗成果、科技进步二等奖5项。先后承担8项国家自然基金重点项目等各类科研课题，基金总额达377万元。主编、副主编专著21部，参编16部，发表论文300余篇。
兼任7个军队和地方学术组织重要职务。担任14家杂志（刊物）主编、副主编、编委等职。
肾内科除完成本科、大专临床教学任务外，还培养硕士研究生28名，博士研究生21名，博士后1名以及大批进修医师、护士。
该科拥有各种医疗科研设备总价值2100万元