消化内科为沈阳军区胰腺疾病研究中心、全军胆胰疾病及消化内镜中心，是全国临床药理基地。现有床位68张，监护病房9张，有主任医师1名，副主任医师2名，主治医师6名，有5人具有博士学位，5人具有硕士学位。科室设有胃镜室，肠镜室，特殊诊查室，分子生物学实验室。
 
    科室是总院发展较快的科室之一，其中门诊就诊病人增长20％，病房住院病人增长10-15％，各项临床发展指标就达到医院整体规划要求。科室时刻铭记为兵服务，长期为军人患者预留床位，多次接收院内军人疑难病例，干细胞移植等最新技术不计费用、不论职务高低，及时对军队适应症患者进行治疗。
 
    科室注重人才培养，可培养硕士研究生、博士研究生、博士后，目前已毕业研究生12人，医院在读硕士4人，博士3人，博士后1人。科室每年带教中国医科大学、大连医科大学、第四军医大学等实习学员50余人，接受各地进修生10余人。多次成功举办全国、全军会议。
 
    科室注重社会、心理、医疗相结合的医学模式，为许多疑难病人解除痛苦、挽救生命。先后获得国家自然科学基金、以及省、部、军队科技成果等奖项30项。发表在国际知名杂志论文200余篇，并获得国家、省及全军研究项目10余项。主编专著3部，参编专著10余部。