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病理科是医院最早成立的研究和诊断科室之一。主要承担医院的医疗、教学及科研工作。
截止到2009年1月，完成临床各种病理活检诊断58000余例, 肿瘤脱落细胞学病理检查30余万例次，肺癌痰细胞学阳性率达到60~70%，大部分肺癌患者术前得到明确诊断，且分型准确。在诊断及鉴别诊断中，开展了组织化学、免疫组织化学、电子显微镜等辅助诊断方法，使病理诊断的准确性达到新的水平。特别在肺部肿瘤、纵隔肿瘤、胸膜肿瘤、肿瘤细胞学及结核病的诊断与鉴别诊断方面有专业特长，居国内先进水平。
在科研和教学工作中，共获得市级及局级科技成果奖10项，公开发表论文40余篇，培养病理专业研究生5名，协助其它科室培养研究生7名。
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