中医科于1956年设立，1999年被上海市卫生局授予综合性医院“示范中医科”，2001年中医脂肪肝特色专科被列入上海市中医特色专科建设单位之一，经过三年的建设，于2004年通过验收并授予铜牌。2005年中医脑血管病专科被列入浦东新区特色专科建设项目，于2007年通过验收。2008年中医冠心病特色专科被列入浦东新区中医特色专科建设项目。

    中医科内设中医内科、中医外科（包括痔科）、中医伤科、针灸科、推拿科、脂肪肝专科等二级分科。共有医师22人，其中主任医师2人，副主任医师6人，主治医师人9人，住院医师5人。博士1名，硕士3名，本科12名，大专6名。同济大学副教授1人，上海中医药大学兼职教授2人，副教授1人。同济大学硕士研究生指导教师1名，共培养3名硕士研究生。

    科室主攻方向为心脑血管疾病、脂肪肝、代谢性疾病、呼吸系统疾病、颈椎病、腰椎间盘突出症、强直性脊柱炎、男性病、妇科病、痔科疾病、针灸减肥等。（1）心脑血管疾病：病房采用多种康复方法进行中医综合治疗（脑循环功能治疗仪、针灸、中药等），同时强调个体化治疗，加强心理疏导，临床疗效显著提高，降低了医疗费用。所承担的市科委中药现代化专项研究项目已通过验收，参与国家973课题研究。（2）脂肪肝：采用院内纯中药制剂——东方肝康口服液治疗，每年平均治疗脂肪肝患者20000人次，临床疗效安全可靠。该专科已形成一套脂肪肝诊断与疗效评估的方法，取得了简易、实用、较准确的效果。该专科已完成市卫生局关于脂肪肝的临床研究课题。（3）腰椎间盘突出症等：对颈椎病、腰椎间盘突出症、强直性脊柱炎的病人采取中医多种疗法，能够明显缓解疼痛，解除了病人的思想负担，提高了生活质量。目前已完成市卫生局临床研究课题，承担新区科委课题研究。（4）男性病：运用针灸、中药治疗男性病，取得了一定的临床疗效。目前针灸科作为主要研究人员单位参与国家973课题研究。