胃肠外科主要开展对胃肠道肿瘤、胰腺肿瘤、甲状腺肿瘤等进行手术为主的综合治疗及腹部良性疾病如门脉高压症、急性重症胰腺炎等常见疾病的手术治疗。在学术、科研方面，科室参加多个国内随机、多中心治疗研究项目，承担多项省、部级课题。

　　在胃肠肿瘤诊治上，紧跟国内外最新动态，结合我国及本院实际，坚持肿瘤治疗的标准化、规范化和个体化原则，开展各类胃肠肿瘤包括胃癌、结肠癌、胃肠间质瘤、胰十二指肠肿瘤、小肠肿瘤等手术;对进展期胃癌所施行的术前新辅助化疗、标准化手术、术后规范化疗及术前后中医药治疗的四联序贯治疗方案使胃癌病人术后五年生存率达65%以上，居国内先进水平。

　　崇尚“以人为本”，重视手术后患者生活质量。在胃癌手术后的消化道重建，保留性功能和排尿功能的直肠癌全系膜切除，超低位保肛手术，新辅助化疗等达到国内先进水平，胃大部切除术后残胃——十二指肠连续性空肠间置术属于国内外首创。

　　在率先开展腹腔镜胆囊切除基础上，成功进行大宗病例微创腔镜下结直肠癌的根治术，并在省内率先开展“三孔法” 微创腹腔镜下结直肠癌的根治术。

　　发挥中医药特色优势，对胃肠道肿瘤术前术后给予中药治疗，取得很好效果，急腹症的中医药治疗，术后肠粘连的预防，早期促康复治疗等，明显减少手术并发症，提高疗效，取得患者一致好评。

　　在腹部良性疾病治疗方面：对胃十二指肠溃疡、食道胃底静脉曲张、脾功能亢进、肠梗阻、肠外瘘、腹外疝、大肠炎性疾病等外科治疗具有丰富的经验，是国内最早开展改良杉浦门奇静脉断流手术、胃肠道瘘肠内营养支持、无张力疝修补术等治疗的单位之一。