胃肠肿瘤外科是以胃肠道肿瘤外科治疗为特色的肿瘤专科，集胃肠道肿瘤的医疗、教学、科研为一体，主要研究方向为贲门、胃体、胃窦、小肠、结肠、直肠和肛管的良恶性肿瘤及腹膜后肿瘤。在科主任、主任医师、中国抗癌协会胃癌专业委员会委员、甘肃省抗癌协会胃癌专业委员会主任委员、甘肃省抗癌协会大肠癌专业委员会副主任委员李兴文主任医师，甘肃省抗癌协会大肠癌专业委员会主任委员李洪华主任医师及副主任医师赵晓宁、袁虎勤、马鸿远为核心的专家群体带领下，多年来致力于胃肠道及腹膜后肿瘤的基础与临床研究。在西北地区率先开展了胃肠道肿瘤术前介入治疗及规范化的胃癌根治性切除（D2、D3）、空肠代胃术、直肠癌根治术（TME）、腹膜后巨大肿瘤切除术、超低位直肠癌保肛手术。科室配备有多功能乙状结肠、直肠及肛门镜检查与治疗器械，设有静脉营养配制室，可配制各种静脉高营养液，实施营养支持治疗。
