内窥镜室占地面积300平方米，候诊室达50平方米，内窥镜洗消室近30平方米，是全市目前面积最大、设备最好的内窥镜室。内窥镜室拥有胃镜、结肠镜、十二指肠镜、支气管镜，其中01ympusV 一套、01ympus145一套、01ympus260三套、Finon99一套，及01ympus 各类纤维内镜多套。此外，内窥镜室拥有符合卫生部要求的肯格王一体化内镜洗消中心及仿01ympus内镜洗消机，并配备了内镜电子干燥消毒储备柜，实现了内镜清洗、消毒、存放一条龙，避免了再次污染的发生。内窥镜室在全市率先开展内镜下的食管、胃底静脉曲张硬化及结扎治疗；消化道良性肿瘤硬化、套扎、微波、高频等治疗；上消化道异物取出(含吻合口缝线拆除及取出)；急性消化道出血的喷注药物、微波凝固、高频点灼电切、硬化剂注射、套扎及钛夹夹闭治疗。在填补全市逆行胰胆管造影术(ERCP)空白的基础上开展十二指肠乳头球囊扩张、切开取石等；食管狭窄的球囊扩张及支架置入；支气管肺泡灌洗术等内镜治疗。
