眼科是省级重点特色专科，2004年2月与北京医科大学合作建立了德州市眼病防治中心，分为白内障人工晶体、青光眼、眼外伤、眼部美容整形、角膜病、眼肌与弱视治疗、眼底病、眼表疾病等8个专业，现开放床位  张，有主任医师3名，副主任医师6名，主治医师2名，主管护师5名，护师2名，配有德国产高性能手术显微镜、超声乳化玻璃体切割一体机、数字化眼底血管造影机、法国产倍频532激光等先进医疗设备。该科紧跟国内眼科新技术、新手术的发展，开展的未成熟期及成熟期白内障超声乳化人工晶体植入术、小切口现代化白内障囊外摘除人工晶体植入术、外伤性白内障前房人工晶体植入术、泪道泪器手术、球后肿瘤摘除术、巨大眶内肿瘤摘除术、抗青光眼显微手术、各种复杂眼外伤手术、斜视矫正、眼部美容整形手术、角膜移植等内、外眼常规及高难度手术均取得了良好的治疗效果。在白内障复明康复工作方面成绩突出，五年脱盲率达98％、脱残率达89％，被评为省级助残先进单位荣誉称号。
   
    眼科在开展临床工作的同时，注重科研工作，涌现出市级拔尖人才1人，院级拔尖人才3人，山东省眼科先进工作者1人，德州市科技进步先进个人1人，近几年取得科研成果15项，其中省卫生厅科技进步一等奖1项，市科技进步一等奖1项、二等奖5项、三等奖5项，在省级以上杂志发表学术论文80余篇。

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