核医科起步于1976年，77年7月同位素室正式对外开诊，是江苏省最早开展核医学工作的县级医院之一。当时即开展了甲状腺吸碘、扫描、甲亢放射性碘治疗等项目。1980年又开展了甲状腺功能检查，包括T3、T4、FT3、FT4、TSH、TG-Ab、TM-Ab。1992年正式建科。目前有主治医师两名，主管技师一名（硕士一名、本科生两名）。主要开展甲状腺功能的全套检查，胰岛功能检测，甲亢放射性碘治疗，生殖激素的检测，肿瘤标志物的检测等项目。甲亢放射性碘治疗是科室的特色，在南通地区处于领先地位，已经有几百例的治疗经验，包括几十年病史的、患有严重并发症的复杂病例，相关文章在省级以上刊物上进行了刊登。
