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心胸外科由胸外科和心脏外科两大专业组成，有主任医师、副主任医师、主治医师、主管护师等医护人员 30 余人，拥有陕南最先进、最完善的监护病房。
胸外科广泛开展食管、贲门、气管、肺部、纵隔、胸膜等部位组织脏器肿瘤的手术，其中食管拔脱治疗食管贲门癌曾获部科技进步奖。心脏外科从 80 年起开展房缺、室缺、动脉导管未闭、法乐式三联症、法乐式四联症、三尖瓣下移、风湿性心脏病的瓣膜置换、心脏肿瘤切除(心脏黏液瘤)及夹层主动脉瘤的支架介入治疗等多种高难度心脏手术，至今有 2000 余例，治愈率达 95% 以上，是目前唯一在陕南开展心脏外科手术的科室。
特别是近年来开展的非体外循环下冠状动脉旁路移植术(冠状动脉搭桥术)，为广大冠心病患者带来了福音，其优点是减少了体外循环带来的一系列并发症，住院时间短、恢复快、费用低、输血少、疗效好。此外，在外科手术治疗乳腺疾病和甲状腺疾病方面积累了丰富的临床经验。
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