内镜科现为陕西省优势医疗专科、安康市首批医学重点专科、安康市内镜诊治中心。有专职医师6人，其中主任医师1名，主治医师2名，医师3名。护士4名，技师1名。兼职医生2人，科室有7个内镜诊疗室和2个专用内镜清洗消毒室。拥有01ympus 260、240型主机5套，18条电子内镜、一条超细经鼻胃镜和超声内镜、胶囊内镜、大量成套内镜下治疗器械和肯格王一体化内镜清洗消毒设备。

　　除开展电子胃镜、肠镜、超声内镜、十二指肠镜、胆道镜、气管镜、喉镜、胶囊内镜检查外，还开展了消化道、呼吸道息肉切除术、食道支架/碘125粒子支架置入术、经皮胃造瘘术、粘膜切除术、十二指肠乳头括约肌切开取石/蛔虫术、胆道狭窄扩张及双支架置入术、鼻胆/胰管引流术、胆道镜液电碎石术、经支气管镜肺活检术、纵隔淋巴结活检、肿瘤微波治疗等内镜下治疗技术39项，其中37项填补我市的空白，19项技术填补全省市级医院空白，1项技术填补省内空白。年诊治患者12800余例，诊断符合率98%，治疗成功率达96%以上。

　　由科主任杨小翠主持完成的科研项目《内镜逆行胰胆管造影诊治胰胆疾病临床应用研究》2002年获市科技进步一等奖，2004年获省科学技术二等奖。现承担省科技计划项目《I125粒子支架治疗晚期食管癌临床应用研究》。2007年被省卫生厅授予“陕西省优势医疗专科”。 2002年起被共青团安康市委授予“青年文明号”，多次被评为“先进科室”、“优质服务科室”。