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血液科是医院四个重点专科之一，并承担广州市核辐射救援中心院内救治基地任务。硕士研究生学历占全科医师70%。科室包括血液病病区、血液病实验室、4张百级层流移植病房。本科主要收治各种白血病、淋巴瘤、再生障碍性贫血、特发性血小板减少等患者。采用免疫细胞治疗再生障碍性贫血更是科的强项。移植方面开展自体、异体骨髓移植治疗白血病和实体瘤取的很好疗效，多次受到省市领导和媒体的慰问和关注，移植成功率达75%，其中采用双份脐带血移植治疗超体重的3例白血病患者已无病生存5年多。目前科室正开展干细胞修复心脏，肝脏，骨头以及神经的研究和治疗工作，并已收到很好的效果。
血液科先后承担教育部科学技术重点项目、广东省医学科研基金项目、广州市科委重点项目、卫生厅医药卫生联合攻关项目、广州市科技局项目、广州市科技攻关项目。2006年在苯致造血损伤的分子诊断及生物治疗方面的研究获得广州市科技进步二等奖和2007年广东省科技进步三等奖。
