福建中医药大学附属人民医院眼科是国家中医药管理局"十五"和"十一五"重点专病，福建省中医眼科重点专科，福建省卫生厅影像及功能实验室，福建省中西医结合眼科研究室，中医眼科硕士授予点，中西医结合眼科硕士培训点，是福建省中医、中西医结合眼科临床、科研、教学培训基地。承担着福建中医药大学本科生、研究生、海外生的教学工作。

    科室拥有世界上最先进的法国BVI公司532nm、810nm双波段半导体激光治疗仪、美国爱尔康白内障超声乳化仪，蔡司高清晰扫描Cirrus HD-OCT、美国Visucam PPO NM免散瞳摄像机、日本TOPCON综合验光仪、瑞士莱卡手术显微镜以及眼底荧光造影仪和视野计、眼电生理仪等大型专科诊疗设备。中西医结合治疗眼底病是本科室的治疗特色，糖尿病视网膜病变、年龄相关性白内障、视网膜静脉阻塞是本科治疗的重点专病。长期以来科室注重围手术期、围激光治疗期的中西医结合治疗，疗效显著，尤其在黄斑新生血管膜的治疗方面有独到之处，位于省内领先。并被CCTV-4中华医药栏目向国内外报道。此外科室还长年开展青光眼、白内障、视网膜脱离手术和青少年近视防治及斜视、弱视治疗，开展各种泪道手术、眼部美容手术和眼表疾病、干眼症等中西医结合治疗。并具备应对眼外伤、眼科急诊急救的治疗能力。