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中医科始建于1958年，经过50年的不懈努力，形成了以中医药学方法为技术特点，医教研全面发展，与军医大学其他专业相匹配的科室。中医科的专科专病建设成绩斐然，现在已经形成以中医理论为指导，中医药成熟技术为骨架，中西医结合为手段，集肿瘤预防、治疗、康复、医教研为一体的专科中心。
拥有独立护理单元的专科病床40张，年收容量肿瘤患者1000余人次。因中西医结合肿瘤治疗特点突出，2006年被批准为陕西省中西医结合肿瘤专科。同年又被批准为国家重点中西医结合肿瘤专科建设单位。2007年成为陕西省抗癌协会传统医学专业委员会挂靠单位。
