本科室包含肝胆胰脾专科和腔镜微创外科两个重要专业，技术力量雄厚，拥有一支团结奋进、朝气蓬勃的医疗团队，目前科室所有的医生都具有硕士以上的学位，其中博士学位4人，教授和副教授4人，硕士研究生导师2人。本科室是福建省腹部外科研究所的重要临床基地，也是福建医大第一临床医学院普外科教研组挂靠单位，已成为集临床、教学和科研为一体的福建省肝胆外科和微创外科中心。
在肝胆胰脾专科方面，开展的巨大肝癌切除、复杂性肝癌切除、高位胆管癌根治、胰腺癌根治、复杂性肝胆管结石治疗以及门静脉高压症治疗在省内居领先地位。
在腔镜微创外科方面，是省内唯一一个能独立全面开展腔镜下胃癌根治、腔镜下肠癌根治、腔镜下肝切除、腔镜下胰腺切除、腔镜下脾切除、颈部无疤痕腔镜下甲状腺切除等微创手术的科室。
此外，在腹外疝的诊治方面也独具特色，开展的局麻下腹股沟疝微创修补术和腔镜下腹股沟疝微创修补术，达到国内先进水平。
