市三院消化科具有病员多、门诊量大、病种多、病情复杂等特点，年门诊量约1万人次，病房年收治病人400多人次。病区开放床位15张，收治各种食管、胃肠及肝胆胰腺疾病患者，在上消化道大出血、急性重症胰腺炎的抢救等方面有丰富的经验。
该科内窥镜中心有电子胃镜2台、纤维肠镜1台，尿素 14C-呼气试验1台，年常规检查胃镜3600多例，肠镜约600例。除常规检查外，还可进行无痛胃镜、无痛肠镜检查，内镜下止血、食道狭窄扩张及支架植入、胃肠道息肉摘除、镜下异物取出术等镜下治疗。
该科现有副主任医师3人、主治医师3人、住院医师3人，在职学习研究生2人，近年共发表省级以上论文30余篇，获乐清市自然科学优秀学术论文奖一等奖2项，二等奖1项、三等奖4项。各级医师学习于温州医学院附属第一医院、温州医学院附属第二医院、上海瑞金医院等名院，使消化科水平再上台阶。该科和温州医学院附属第一医院消化科建立了比较密切的联系，得到他们在技术上的大力支持。
