阜南县中医院于1998年3月创办成立，正科级事业单位，占地面积10亩，建筑面积10560m2，床位编制446张，人员编制669人，2006年被批准为“二甲”中医院；2013年7月再次通过“二甲”评审验收；2011年，在县委、县政府、县卫生局的带领下，实现了创建“全国农村中医药工作先进单位”目标任务。2012年门诊量11.8万人次，出院病人1.5万人次；目前医院开放床位300张，日均住院病人300多人；现有职工408人，其中：专业技术353人，高级12人，中级79人；2012年招聘中医药院校毕业生14人；2013年招聘中医药院校毕业生15人；设有急诊科、心血管病科、脑病科、骨伤科、外科、针灸推拿科、妇产科、眼耳鼻喉科、检验科、放射科、B超室等临床医技科室23个，行政职能科室18个，二级科室21个，有CT、彩超、闭路电视X光机、电子胃镜、自动生化分析仪等大中型设备20多台件；2012年起动了新院建设工程项目，预计2年建成并投入使用。建院15年来，在中医药政策精神的指引下，在各级主管部门及县委、县政府的关心和支持下，医院从白手起家做起，从无到有，从小到大，从弱到强，业务蒸蒸日上，两个效益逐年递增，呈现出良好的发展势头。

阜南县中医院坚持以病人为中心，以创新工作思路，改善办医条件，提高医疗质量，突出中医特色，推行优质服务，加快建设发展为办院宗旨，注重人才引进和培养，努力打造名院、名科、名医的特色品牌，现已成为市级“诚信单位”、城镇职工医疗保险、居民医保、法院法医技术鉴定、各类体检和新农合定点医院、阜南县医疗卫生事业骨干单位。