焉耆县人民医院始建于1952年12月，是一所集医疗、教学、预防保健、康复、急救、社区卫生服务为一体的综合性二级甲等医院，系四川大学华西医院、新疆医科大学第一附属医院、自治区人民医院远程会诊、远程教学定点医院；河北医科大学第二、第三附属医院、新疆医科大学第一附属医院、自治区人民医院技术协作医院，新疆医科大学、甘肃平凉医专、巴州卫校教学实习医院；山东齐鲁医药学院、甘肃河西学院实习+就业合作医院。2013年5月7日-8日，焉耆县人民医院代表巴州卫生局接受了自治区卫生厅等级医院评审验收，并以优异的成绩在全疆首家通过了国家二级甲等医院评审。2014年10月率先在全疆开展医疗县乡村一体化管理，2019年6月纳入焉耆县医共体管理。

医院占地总面积37000平方米，其中业务用房面积32000平方米，固定资产1.7亿元。编制床位450张，开放床位590张。医院现有职工627名，在编368人，聘用259人，其中卫生专业技术人员 518人，高级职称92名，中级职称115名，研究生学历4名。80％业务骨干曾到疆内外三甲医院进修学习。长期以来，医院得到了疆内外三甲医院的大力支持和帮扶，系四川大学华西医院、廊坊市人民医院、新疆医科大学第一附属医院、自治区人民医院、自治区肿瘤医院、胸科医院、巴州人民医院远程会诊医院；与新医大一附院心脏中心、介入中心，自治区人民医院康复科、儿科、巴州人民医院康复科建立了医联体；与自治区三甲医院建立了麻醉、皮肤性病、风湿免疫、传染病、银屑病、眼科、儿科专科联盟，让患者在家门口就享受到了三甲医院的专家服务，为广大患者带来了福音。

医院设有重症医学科等临床科室15个，急诊科、手麻科等亚临床科室4个，医技、功能科室9个，职能、总务后勤服务科室20个。配备1.5T核磁共振、64排128层CT、血管造影机、乳腺钼靶机、数字胃肠仪、等医疗设备200余台（件），为临床诊断治疗提供了保证。

医院能够救治急性心肌梗塞、脑卒中、重度颅脑外伤、重症急性胰腺炎等危重病人，救治成功率达90%以上。能够开展腹腔镜下胆囊摘除、阑尾切除，胃、结、直肠癌、膀胱癌、肾癌根治术，关节镜下前后交叉韧带重建术、颅内肿瘤切除术，腹腔镜下子宫全切术，卵巢癌、宫颈癌根治术，冠状动脉造影及支架置入术，十二指肠镜下胰胆管诊疗术，内镜下食道静脉曲张套扎术等高难度复杂手术及微创手术，多项技术填补了巴州县级医院空白；内科系统在心血管、肾病、内分泌、消化呼吸系统等疾病诊疗方面形成特色。

医院先后获得自治区先进基层党组织、卫生红旗单位、无烟先进单位、自治州级三八红旗集体、医院管理先进单位、花园式单位、先进基层党组织、继续医学教育先进单位、助残先进单位、文化卫生发展年先进集体、模范职工之家、五四红旗团支部、全民健康体检工程先进集体、自治县民族团结一家亲联谊活动先进集体等荣誉称号！