吉林市结核病专业防治工作始于1956年。吉林市结核病防治所于当年正式开诊，设专科门诊治疗肺结核病，同时开展肺部透视及健康体检工作，结束了吉林市区没有专业结核病医疗机构的历史。1957年增设了预防儿童结核诊室，1958年在全地区开展儿童卡介苗接种，1959年开始组成结核防治巡回医疗队，深入厂矿乡村进行结核病普查。1976年至1977年，开展了以结核病为重点的全民慢性病普查、普治，两年免费检查近百万人，为全市开展结核病防治起到了有力的推动作用。1966年，市结防所提出了“早期发现、积极治疗、防止传染”的防控原则，并贯彻全国结核学术会议提出的“早期、足量、联合用药、长期、不间断”的化疗原则和“查出必治、治必彻底”的防治要求;1978年实行“查出必治、治必合理、治必彻底”及“早期、联用、适量、规律、全程”的新化疗原则，将全市结核病防治工作推向一个新的阶段。通过采用合理的化疗方案和国产高效抗结核药物的普遍使用，使全市结核病发病率、死亡率迅速降低。
文革期间，全市结防工作受到冲击，结核病患病率一度上升，全市人民健康受到严重威胁。党的十一届三中全会以后，通过积极整顿，大力提高医疗预防工作质量，全力开展结核病防治工作，迅速扭转了局面，结核病防治工作取得明显成效，预防、医疗、科研都取得了较快发展。
1985年至1990年，组织了两次大规模的全地区流行病调查，并制定了全市结核病疫情发现及防控工作战略。同时，增设了部分医疗设备，设置了结核病人观察床，结束了危重病人不能在专业机构住院治疗的历史。通过强化预防工作、落实病人归口管理、抓好县区督导和人员培训，全面提高吉林地区结防工作质量，为结防工作实现跨越式发展做好了准备。
近年来，结核病的传播已严重危害公众健康，成为倍受关注的重大公共卫生和社会问题。面对结核病高发的严峻趋势，市结防所始终坚持“预防为主，防治结合”的工作方针，全面实施现代结核病控制策略，建立了以政府为主导，各部门广泛参与的结核病防控体系，形成了结核病控制可持续发展的有效机制，并以世行贷款/英国赠款结核病控制项目为突破口，以提高病人发现率和治愈率为重点，通过强化项目管理和督导，有效保证全市结核病控制工作的均衡发展。到2005年，我市已全面实现结核病防治10年规划的中期目标，全地区DOTS覆盖率达到了100%;2000年至今全市共登记结核病人33538人，其中涂阳结核病人15498人，治愈率达94.8%。我市已完成中国结核病加强项目，FIDELIS项目和全球基金第五轮结核病/艾滋病双感项目，全市结核病防治工作连续四年在全省排名第一。
经过不断努力，全市已经实现了各县(市)区结防机构对综合性医院的垂直管理，建立并规范了结核病报告、转诊登记制度;实现了结核病疫情网络直报，全市综合医院结核病转达诊率达95%以上。推出了结核病人管理进社区的新举措，在市区形成了结核病人全方位管理的新格局。全市三级防镑网培训率达100%。通过每年对大、中、小学新生集中结核病检测，对遏制传染源，降低结核病传播起到了十分重要的作用。