平潭综合实验区中医院创建于1985年12月，是由当时的平潭县政府招待所改建而成，医院占地面积6010平方米，建筑面积10126平方米，医疗业务用房5837.5平方米。

建院以来，在上级党委、政府和卫生主管部门的领导下，在医院历任领导和医务人员的共同奋斗下，医疗环境不断改善，医疗功能不断完善，中医能力不断提升，综合实力不断增强，于2013年12月获批通过福建省卫生厅的等级医院评审，是平潭综合实验区目前唯一的一所集医疗、教学、科研、保健康复于一体的国家二级甲等中医院。

为推进县级公立医院综合改革和发展转型升级，经管委会批准，2015年9月正式更名为“平潭综合实验区中医院”，标志我院进入发展新时期。

医院作为福建中医药大学附属人民医院协作医院，中西医结合优势突出，中医特色浓厚。现有医务员工200余人，其中卫生技术专业人才占职工总数的80%，中医药类别人才占卫生技术人才的60%。

根据省卫生厅2013年6月批复编制病床位为200张，我院设有中西医结合内科、外科，骨伤科、康复科、老年病科（三科获批省级在建农村医疗结构中医特色专科）、妇产科（获中医药管理局批国家级在建农村医疗结构中医特色专科）、儿科、五官科、肛肠科、皮肤科、推拿科、针灸科、门急诊科、心理咨询室等临床科室，下设消化脾胃专科、内分泌糖尿病专科、肾病专科门诊、中医肝病专科（获批为福建省中医重点专科）、泌尿科男科；设有放射科、CT室、B超室、检验科、胃镜室、心电图室等医技科室，尤其是与跨地区连锁经营的独立医学实验室——艾迪康医学检验中心合作，采取欧美独立实验室的先进管理体系和国际高端质量标准，可送检220多项特色项目、1100多项检测项目，确保了检验质量与效率，可满足病人和健康体检人群的需求。

新的历史机遇下，医院党政领导班子紧密团结全院职工，振奋精神，迎难而上，努力奋斗，顺应平潭综合实验区大开放、大发展的良好态势，坚持“以人为本、传承创新、医技领先、彰显博爱”的人文精神，以建设“三好一满意”医院为抓手，把中医院各项工作提升到更高的层次，以优质的服务、精湛的技术、高尚的医德、优美的环境，为广大人民群众的健康造福，为平潭综合实验区的建设发展发挥医疗机构应有的保障作用。